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这几个数据库轻松搞定2020年的网盟购彩用户注册懊恼~

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Genbank库包(bao)罗了一切(qie)已知的核酸序列(lie)和(he)卵白质序列(lie),和(he)与它们相干的文(wen)献著述和(he)生物学正(zheng)文(wen)。它(ta)是由美(mei)国国立(li)生(sheng)物手(shou)艺网盟(meng)购彩用户注册中间(NCBI)成立(li)和保(bao)护的(de)。它的数(shu)据间接来(lai)历于(yu)测序任务者提交的序列;由测序中间提交的大批EST序列(lie)和别(bie)的测序数据;和(he)与别(bie)的(de)数据机构协作互换数据而来。Genbank天(tian)天(tian)城(cheng)市与(yu)欧洲(zhou)份子生物学(xue)尝试(shi)室(EMBL)的数(shu)据(ju)库(ku),和日本的DNA数(shu)据(ju)库(ku)(DDBJ)互换(huan)数(shu)据(ju),使这三个数(shu)据(ju)库(ku)的数(shu)据(ju)同步。Genbank的(de)数据能够从NCBI的(de)FTP办事器(qi)上(shang)收费下载完全的(de)库,或下载堆集(ji)的(de)新(xin)数据。NCBI还(hai)供给(ji)普遍的(de)数据查问、序列类似性搜刮和别的(de)阐发办事(shi),用户能够(gou)从NCBI的(de)主(zhu)页(ye)上找到这些办事(shi)。

Genbank库里(li)的数据按来历于约55,000个(ge)物种,此中(zhong)56%是人类的基因组序(xu)(xu)列(一切序(xu)(xu)列中(zhong)的34%是人类的EST序(xu)(xu)列)。每(mei)条Genbank数据记实包(bao)罗了对序列的扼要描写,它的迷(mi)信(xin)定名,物种(zhong)分类称号,参考文献,序列特点表,和(he)序列自身(shen)。序列特(te)点(dian)表(biao)里(li)包罗(luo)对(dui)序列生物学特(te)点(dian)正文如:编码区、转录(lu)单(dan)位、反复地区、渐变位点或润色位点等。一(yi)切数(shu)据记实被分别在多少个文(wen)(wen)件(jian)里,如细菌(jun)类(lei)、病毒类(lei)、灵长类(lei)、啮齿(chi)类(lei),和EST数(shu)据、基因组测序数(shu)据、大范围基因组序列数(shu)据等16类(lei),此中EST数(shu)据等又被各自(zi)分红多少个文(wen)(wen)件(jian)。

NCBI的数据库检索查问体(ti)系是Entrez。Entrez是基(ji)于Web界面的综合(he)生物网盟购彩用户注册(ce)数据库检索体系。操纵Entrez体系,用户(hu)不只能(neng)够便利地检索(suo)Genbank的(de)核酸(suan)数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju),还能(neng)够检索(suo)来自Genbank和别(bie)的(de)数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)库(ku)的(de)卵白质序(xu)列(lie)数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)、基因组图谱数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)、来自份子模子数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)库(ku)(MMDB)的(de)卵白质三(san)维布局数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)、种群序(xu)列(lie)数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)集(ji)、和由(you)PubMed取得(de)Medline的(de)文献数(shu)(shu)据(ju)(ju)(ju)(ju)。
Entrez供给(ji)了便利适(shi)用(yong)的(de)检索办事(shi),一切操纵都能够(gou)在收集阅读器上完成。用户能够操纵Entrez界面上供给(ji)的限定前提(Limits)、索引(Index)、检索汗(han)青(History)和剪贴板(Clipboard)等(deng)功效来完成(cheng)庞杂的检索查问任(ren)务。对检(jian)索取得(de)的(de)记实,用户能够挑(tiao)选须要(yao)显(xian)现的(de)数据,保管(guan)查问成果,乃至以(yi)图形体例旁(pang)观检(jian)索取得(de)的(de)序列(lie)。更(geng)具(ju)体的Entrez利用申(shen)明能够在(zai)该主(zhu)页上取(qu)得。
(2)向Genbank提交序列数据
NCBI的网址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Entrez的网址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/
BankIt的网址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt
Sequin的相干网址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/
02.EMBL核酸(suan)序列数(shu)据(ju)库
 
SRS的网址是:http://srs.ebi.ac.uk/
 
日(ri)本DNA数(shu)据(ju)堆栈(zhan)(DDBJ)也是一个周全的核(he)(he)酸序列数(shu)据(ju)库(ku),与Genbank和EMBL核(he)(he)酸库(ku)协作(zuo)互换数(shu)据(ju)。能够(gou)利(li)用(yong)其主页(ye)上(shang)供给的SRS东(dong)西停止数据检(jian)索和序(xu)列阐发。能够用Sequin软件向该数(shu)据库提(ti)交序(xu)列。

DDBJ的网址是:http://www.ddbj.nig.ac.jp/
04.GDB数据库
 

 

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今朝GDB中有:人类基因组地区(包含基因、克隆、amplimers PCR 标记、断点breakpoints、细胞遗传标记cytogenetic markers、易碎位点fragile sites、EST序列、综合地区syndromic regions、contigs和反复序列);人类基因组图谱(pu)(pu)(包含细胞遗传图谱(pu)(pu)、毗连图谱(pu)(pu)、喷射性杂交图谱(pu)(pu)、content contig图谱(pu)(pu)和综合图谱(pu)(pu)等);人类(lei)基因组内的变异(包含(han)渐变和多态性,加上(shang)等位基因频次数据)。GDB数(shu)据库以工具(ju)模子来保(bao)管数(shu)据,供(gong)给基(ji)于(yu)Web的(de)数(shu)据工具(ju)检(jian)索(suo)办事,用户能(neng)够搜刮各类范例的(de)工具(ju),并以图形(xing)体(ti)例旁观基(ji)因组图谱(pu)。

GDB的网址是:http://www.gdb.org
GDB的国际镜像是:http://gdb.pku.edu.cn/gdb/


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